Šta treba znati
- Neke PDB datoteke su datoteke programske baze podataka.
- Otvorite jedan sa uređivačem teksta ili programom kao što je Geneious.
- Pretvorite u drugi format sa istim programom koji otvara vašu specifičnu datoteku baze podataka.
Ovaj članak objašnjava šta je PDB datoteka, kako je otvoriti i kako je pretvoriti u drugi format.
Šta je PDB datoteka?
Datoteka sa PDB ekstenzijom datoteke je najvjerovatnije datoteka baze podataka programa koja se koristi za čuvanje informacija o otklanjanju grešaka o programu ili modulu, kao što je DLL ili EXE datoteka. Ponekad se nazivaju fajlovi simbola.
Datoteka mapira različite komponente i iskaze u izvornom kodu u svoj konačni kompajlirani proizvod, koji debuger zatim može koristiti da pronađe izvorni fajl i lokaciju u izvršnom fajlu na kojoj bi trebao zaustaviti proces otklanjanja grešaka.
Neke PDB datoteke mogu umjesto toga biti u formatu datoteke Protein Data Bank. Ovo su obični tekstualni fajlovi koji pohranjuju koordinate u vezi sa strukturama proteina.
Druge PDB datoteke mogu se kreirati u Palm Database ili PalmDOC formatu datoteke i koristiti sa PalmOS mobilnim operativnim sistemom; neke datoteke u ovom formatu umjesto toga koriste ekstenziju datoteke. PRC. Još jedan format koji koristi istu ekstenziju je Tanida Demo Builder.
Kako otvoriti PDB fajl
Različiti programi koriste svoju PDB datoteku za pohranjivanje podataka u neku vrstu strukturiranog formata baze podataka, tako da se svaka aplikacija koristi za otvaranje vlastitog tipa.
Geneious, Quicken, Visual Studio i Pegasus su samo nekoliko primjera programa koji mogu koristiti datoteku kao datoteku baze podataka. Radare i PDBparse također mogu raditi.
Neke PDB datoteke se pohranjuju kao običan tekst, poput Geneiousovih datoteka Program Debug Database, i potpuno su čitljive ljudima ako se otvore u uređivaču teksta. Ovu vrstu PDB datoteke možete otvoriti bilo kojim programom koji može čitati tekstualne dokumente, kao što je ugrađeni program Notepad u Windowsu. Neki drugi kompatibilni preglednici i uređivači uključuju Notepad++ i zagrade.
Ostali PDB fajlovi nisu tekstualni dokumenti i korisni su samo kada se otvore programom za koji su namenjeni. Na primjer, ako je vaš na neki način povezan s Quicken-om, pokušajte koristiti taj softver da ga pregledate ili uredite. Visual Studio očekuje da vidi PDB fajl u istoj fascikli kao i DLL ili EXE fajl.
Možete pregledavati i uređivati datoteke Protein Data Bank u Windows, Linux i macOS uz Avogadro. Ovi programi također mogu otvoriti datoteku: Jmol, RasMol, QuickPDB i USCF Chimera. Pošto je ovo običan tekst, možete ga otvoriti iu uređivaču teksta.
Palm Desktop bi trebao biti u mogućnosti da otvori ovu datoteku ako je u formatu datoteke Palm Database, ali možda ćete je morati prvo preimenovati da biste imali PRC ekstenziju datoteke da bi je taj program prepoznao. Kalibar je druga opcija.
Da otvorite PalmDOC PDB fajl, isprobajte STDU Viewer.
Tanida Demo Builder otvara fajlove u tom formatu.
Kako pretvoriti PDB fajl
Datoteke baze podataka programa najvjerovatnije se ne mogu konvertirati u drugi format datoteke, barem ne pomoću običnog alata za pretvaranje datoteka. Umjesto toga, ako postoji bilo koja aplikacija koja može konvertirati ovu vrstu datoteke, to bi bio isti program koji bi je mogao otvoriti.
Na primjer, ako trebate konvertirati datoteku baze podataka iz Quicken-a, pokušajte koristiti taj program da to učinite. Ova vrsta konverzije, međutim, vjerovatno nije samo od male koristi, već i nije podržana u ovim aplikacijama baze podataka (tj. vjerovatno ne morate konvertirati ovu vrstu PDB datoteke u bilo koji drugi format).
Datoteke banke podataka proteina mogu se konvertovati u druge formate pomoću MeshLab-a. Da biste to uradili, možda ćete morati prvo da je konvertujete u WRL sa PyMOL-om iz File > Sačuvaj sliku kao > VRML meni, a zatim uvezite WRL datoteku u MeshLab i koristite meni File > Izvezi mrežu kao da na kraju pretvorite PDB datoteku u STL ili drugi format datoteke.
Ako vam nije potrebno da model bude u boji, možete eksportovati datoteku direktno u STL pomoću USCF Chimera (link za preuzimanje je iznad). U suprotnom, možete koristiti isti metod kao gore (sa MeshLab-om) da pretvorite PDB u WRL sa USCF Chimerom, a zatim izvezete WRL u STL sa MeshLab-om.
Pretvoriti PDB u PDF ili EPUB, ako imate PalmDOC datoteku, moguće je na više načina, ali je vjerovatno najlakši koristiti online konvertor kao što je Zamzar. Možete prenijeti svoju datoteku na tu web stranicu da biste imali opciju konvertiranja u te formate, kao i u AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT i druge formate e-knjiga.
Da biste konvertovali jedan u FASTA format, možete koristiti Meiler Lab online PDB u FASTA konvertor.
Ovu datoteku je također moguće sačuvati u CIF (format kristalografskih informacija) online koristeći PDBx/mmCIF.
Još uvijek ne možete otvoriti?
Datoteke koje se ne otvaraju bilo kojim od gore navedenih alata vjerovatno nisu PDB datoteke. Ono što se može dogoditi je da pogrešno čitate ekstenziju datoteke; neki formati koriste sufiks koji je vrlo sličan PDB-u, kada zaista nisu povezani i ne rade isto.
Na primjer, PDF datoteka je datoteka dokumenta, ali većina gore navedenih programa neće ispravno prikazati tekst i/ili slike ako pokušate da otvorite jedan sa ovim softverskim programima. Isto važi i za druge datoteke sa sličnim napisanim ekstenzijama, kao što su DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO i WPD fajlovi.
PBD je još jedan koji pripada EaseUS Todo Backup programu i stoga je koristan samo kada se otvori tim softverom.
Ako nemate PDB datoteku, istražite ekstenziju datoteke koju vaš fajl ima tako da možete pronaći odgovarajući program koji ga otvara ili pretvara.
Napredno čitanje PDB datoteka
Možete pročitati mnogo više o datotekama baze podataka programa sa GitHub-a i Wintellect-a.
Možete još naučiti o datotekama Protein Data Bank; pogledajte Svjetsku banku podataka o proteinima i RCSB PDB.
Često postavljana pitanja
- Kako da to popravim kada Visual Studio ne može pronaći ili otvoriti PDB fajlove? Ako vidite poruku u kojoj se navodi da Visual Studio ne može pronaći ili otvoriti PDB datoteku, pokušajte koristeći Visual Studio alat za otklanjanje grešaka. Idite na Alati > Opcije > Debugging > SymSym odaberite Microsoft Symbol Servers
- Kako da otvorim PDB fajl na Androidu? Da otvorim PDB fajl na Androidu, koristite čitač fajlova treće strane. Preuzmite aplikaciju Cool Reader ili bilo koji drugi čitač koji podržava PDB fajlove na Google Playu.
