Šta treba znati
- FNA fajl je FASTA format DNK i datoteka za poravnanje sekvence proteina.
- Otvorite jedan sa Geneiousom.
- Pretvorite u FASTA i slične formate sa istim programom.
Ovaj članak objašnjava šta je FNA datoteka, kako je otvoriti i kako je sačuvati u drugom formatu kao što je FASTA, GB, VCF, slike, itd.
Šta je FNA fajl?
Datoteka sa ekstenzijom datoteke FNA je datoteka za poravnanje DNK i sekvence proteina FASTA formata koja pohranjuje informacije o DNK koje može koristiti softver za molekularnu biologiju.
FNA datoteke, konkretno, mogu se koristiti za držanje samo informacija o nukleinskoj kiselini, dok drugi FASTA formati sadrže druge informacije vezane za DNK, kao što su one sa FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET ili AA ekstenzije datoteka.
Ovi tekstualni FASTA formati prvobitno su nastali iz softverskog paketa sa istim imenom, ali se sada koriste kao standard u aplikacijama za usklađivanje sekvenci DNK i proteina.
FNA se takođe odnosi na neke tehnološke termine koji nemaju nikakve veze sa ovim formatom datoteke, kao što je konačno prihvatanje mreže, mogućnost povećanja imena/atributa, Fujitsu mrežna arhitektura i brzo reklamiranje susjeda.
Kako otvoriti FNA fajl
Otvorite jedan u Windowsu, macOS-u i Linuxu uz Geneious (besplatno je 14 dana). Da biste to učinili, idite na meni File > Import i odaberite uvoz datoteke putem From Filestavka menija.
Možda ćete ga moći otvoriti i sa BLAST Ring Image Generatorom (BRIG).
Probajte Notepad++ ili neki drugi uređivač teksta ako te ideje ne funkcioniraju. Datoteka bi zaista mogla biti zasnovana na tekstu i jednostavna za čitanje, ili ćete možda otkriti da nema nikakve veze s FASTA formatom, u kom slučaju otvaranje datoteke kao tekstualnog dokumenta može otkriti tekst koji identificira šta je korišteno za kreiranje datoteke ili u kom je formatu fajl.
Kako pretvoriti FNA fajl
Ovo ne možemo provjeriti jer ga nismo isprobali, ali trebali biste moći koristiti Geneious da konvertujete fajl u mnoge druge formate, kao što su FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV i VCF. Ovo se može uraditi preko menija File > Export.
Taj isti program bi takođe trebao moći da sačuva datoteku u PNG, JPG, EPS ili PDF, putem File > Sačuvaj kao datoteku slike.
Iako obično ne možete jednostavno preimenovati ekstenziju datoteke u nešto drugo i očekivati da će raditi na isti način, možete preimenovati. FNA datoteku u. FA datoteku ako će vaš softver za sekvenciranje DNK prepoznati samo FA format.
Umjesto preimenovanja ekstenzija datoteka, htjet ćete koristiti besplatni pretvarač datoteka za konverziju drugih tipova datoteka. U slučaju sa FNA i FA datotekama, jednostavno se dešava da će neki programi otvoriti samo datoteke koje imaju ekstenziju FA datoteke, u kom slučaju bi preimenovanje trebalo dobro funkcionirati.
Još uvijek ne možete otvoriti?
Ako nakon korištenja gore navedenih programa i dalje ne možete otvoriti svoj fajl, možda ćete otkriti da ekstenzija datoteke zapravo ne čita. FNA, već nešto što samo izgleda slično.
Na primjer, FNG (Font Navigator Group) datoteke izgledaju užasno kao da kažu ". FNA", ali ako bolje pogledate, samo su prva dva slova ista. Budući da su ekstenzije datoteka različite, to je pokazatelj da su različitog formata datoteke i da najvjerovatnije neće raditi s istim programima.
Isto se može reći i za mnoge druge ekstenzije datoteka kao što su FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue funkcije) i FND (Windows sačuvana pretraga).
Ideja ovdje je samo osigurati da ekstenzija datoteke glasi. FNA. Ako jeste, pokušajte ponovo koristiti programe odozgo da biste ga otvorili ili pretvorili. Ako imate drugu vrstu datoteke, istražite njenu ekstenziju da saznate koje su aplikacije potrebne za otvaranje ili konverziju.
FAQ
Kako otvoriti FNA fajl u Pythonu?
Prvo, pretvorite FNA datoteku u FASTA format koristeći aplikaciju treće strane kao što je Geneious. Zatim možete preuzeti Biopython, skup besplatno dostupnih alata za biološko računanje za rad u bioinformatici. Konačno, pogledajte Biopython Tutorial i Cookbook za upute o radu sa FASTA datotekama.
Kako da pronađem svoje brojeve proizvođača FNA u sirovom fajlu Ancestry?
Većinu DNK podataka možete preuzeti sa Ancestry.com u.txt formatu. Međutim, samo kupci čija je DNK analizirana sekvenciranjem sljedeće generacije (NGS) imaju mogućnost preuzimanja VCF datoteke. Da preuzmete VCF fajl, morate biti vlasnik DNK, imati DNK testiran pomoću NGS tehnologije i imati najmanje 350 MB slobodnog prostora na svom uređaju.
